中心依據主管機關訂定之身心障礙托育養護收費原則及發展遲緩兒童療育補助之規定進行收費，並協助申請補助，另外欲搭乘交通車之學童，中心得代向政府申請交通補助費後，酌收其差額。
日間托育：
日間托育費依障礙程度進行不同收費，重度為12,000元，中度為9,600元，家長得申請托育養護補助，補助標準詳見(相關附件)。
部份時制：
每堂課收費600元，家長得申請療育補助一般第每人每月至多3,000元，低收入戶每人每月至多5,000元，其補助標準詳見(療育補助計畫、申請書)。
課輔班：
學童依其上課天數進行收費，家長得申請中低收入生活津貼或身心障礙者生活津貼。
